Jakob Lorentzen har siden 1997 beklædt stillingen som organist og kantor ved Holmens Kirke samt slotsorganist ved Christiansborg Slotskirke. Han er en efterspurgt solist og kammermusiker med utallige årlige koncerter i ind- og udland.

I Holmens Kirke står han i spidsen for Holmens Kantori, Holmens Vokalensemble og Holmens Barokensemble

Som komponist har Jakob Lorentzen skrevet en del værker som er udgivet på danske musikforlag, ligesom han medvirker på en lang række cd’er med kor- og orgelmusik. Jakob Lorentzen har modtaget Dronning Ingrids Mindemedalje samt mange priser og legater. Han spiller ofte ved gudstjenester og kirkelige handlinger med kongehusets deltagelse.